Die zweite Etappe führte die Fahrer von San Luis nach San Rafael (Argentinien) - 354 Kilometer durch Felder und Felsen, davon 70 Kilometer durch Sanddünen. Dünenspezialist Sam Sunderland kam das entgegen, so dass er den Streckenabschnitt in 3:42 Stunden für sich entscheiden konnte. Joan Barreda kam mit zwei Minuten Rückstand auf dem dritten Platz ins Ziel, wobei er auf der Etappe mit einer Kuh zusammenstieß. Er blieb unverletzt, aber sein Roadbook (dort werden die Karten für die Navigation gesteuert) wurde beschädigt, so dass er die Karten per Hand drehen musste. Barreda ist weiterhin Gesamtführender in der Dakar.
Sam Sunderland: "Ich bin sehr glücklich. Das Motorrad läuft fantastisch, durch alle Geländearten lässt es sich leicht bewegen. Vor allem in den Dünen kam ich gut zurecht. Als ich einen Fluss durchquerte und der tiefer war, als ich dachte, erntete ich ein paar Lacher von Zuschauern. Trotzdem, ich bin sehr stolz auf meinen ersten Sieg bei der Dakar."
Die weiteren Honda Fahrer kamen wie folgt ins Ziel: Der Portugiese Paulo Gonçalves wurde 8, sein Landsmann Helder Rodrigues 15. und der Argentinier Javier Pizzolito beendete die Etappe auf dem 21. Platz.
Gesamtwertung nach der zweiten Etappe:
1. Joan Barreda 6:09:41 Stunden
3. Sam Sunderland + 2:33 Minuten Rückstand
7. Paulo Gonçalves + 8:10 Minuten Rückstand
Die Rallye dauert noch bis zum 18. Januar 2014 an.
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