Der Rapid Spaceback folgt dem Konzept des Audi A3 Sportback und bekommt einen kürzeren Überhang samt makantem Heck. Durch die sportlichere und im Vergleich zur Limousine zehn Zentimeter kürzeren Karosserie bietet der Sportback anders als klassische Kombis mit 550 Litern nicht mehr Kofferraumvolumen als die Limousine.
Als Extra bietet Skoda beim Spaceback für einen geringen Aufschlag eine Verglasung, die bis in die Heckklappe reicht. Skoda wird nach Kritik an der Materialqualität im Innenraum des Rapid beim Spaceback nachbessern und eine hochwertigere Oberfläche einsetzen. Die Motorenpalette reicht wie bei der Limousine vom günstigen Saugbenziner mit 75 PS über den aufgeladenen 1.2 TSI (86 und 105 PS) bis zum aufgeladenen 1.4 TSI mit 122 PS. Als Diesel steht lediglich der 1.6 TDI mit maximal 105 PS zur Wahl.