Mit der erweiterten Volltextsuche können nicht nur Indexdaten sondern alle Dokumentinhalte und Notizen nach Begriffen durchsucht werden. Die Ergebnisse werden in einer Vorschau-Trefferliste aufgelistet, in welcher der Suchbegriff im Textkontext angezeigt und hervorgehoben wird - analog zur „google-Suche“. Von dort springt der Anwender direkt auf die jeweilige Seite, wo der Suchbegriff ebenfalls farblich hervorgehoben wird. Die serverbasierte Volltextsuche kann mit praktisch allen Dokumentformaten umgehen, da Dokumente, die als Bild vorliegen mittels Texterkennung erschlossen werden.
Anwender aus dem Bereich der MDK-Bearbeitung waren nach der Testnutzung des PEGASOS 6.3 Clients überzeugt: Die erweiterten Funktionen für Annotationen und die Volltextsuche erlauben ein effektives Arbeiten mit Digitalakten, so dass man gänzlich auf die Papierakte verzichten könne.