TEMIS, führender Anbieter von Textanalyselösungen stellt mit Luxid® for Life Sciences erstmals eine branchenspezifische Version seiner generischen Plattform Luxid® vor, die insbesondere die Bedürfnisse der Lebenswissenschaften aufgreift.
In kaum einem Bereich sind die Anforderungen an die Analyse von textuellen Informationen so hoch wie in diesem Gebiet. Viele tausend Proteine oder Krankheiten, viele Millionen von Organismen und buchstäblich unzählige chemische Substanzen können auf vielfältige Arten und Weisen mit einander interagieren. Die Suche nach einem viel versprechenden Wirkstoff oder das frühzeitige Aufspüren von unerwünschten Nebenwirkungen gleicht oft der sprichwörtlichen Suche nach der Nadel im Heuhaufen. Die stürmische Publikationstätigkeit der Wissenschaft und die hohen Anforderungen der Zulassungsbehörden tun ein Übriges, um die Suche nach geeigneten Verfahren der Textanalyse zu befeuern.
TEMIS Luxid® for Life Sciences greift diese Bedürfnisse auf und unterstützt die Wissenschaftler aus den Forschungs- und Entwicklungsabteilungen bei der Auswertung der ständig wachsenden Fachliteratur. Luxid® bietet zahlreiche Funktionen zur Analyse von Beziehungen zwischen biologischen, medizinischen und chemischen Einheiten. Vielfältige Navigationsmöglichkeiten auf den analysierten Texten erlauben es, sich rasch einen Überblick über den Stand der Forschung zu verschaffen und Hypothesen beispielsweise über die Eignung einer Zielsubstanz für den medizinischen Einsatz oder Verwendung chemischer Substanzen bewerten können.
Luxid® for Life Sciences unterstützt außerdem Rechtsabteilungen bei der Arbeit mit Patenten. Das System kann verschiedenartige Patentquellen sammeln sowohl die jeweils verfügbaren Metadaten (Einreicher, Patentklassifikationscode…) normalisieren als auch die relevanten Einheiten im Volltext (Gene, Krankheiten, chemische Zusammensetzungen …) analysieren. Patentanwälte können damit rascher patentrechtlich freie Möglichkeiten im Bereich viel versprechender chemischer Zusammensetzungen analysieren und mögliche Patentverletzungen frühzeitig erkennen.
Schließlich unterstützt Luxid® for Life Sciences die Marketing- und Sicherheitsabteilungen bei der Überwachung möglicher Risiken aufgrund von Nebenwirkungen. Die Software automatisiert die Entdeckung von Nebenwirkungen durch die Extraktion relevanter Bezüge zwischen Arzneimitteln, Therapien und dadurch hervorgerufenen pathologischen Befunden oder Symptomen.
”Wir haben unsere erste branchenspezifische Version von Luxid® an den Anforderungen unserer anspruchsvollsten Life-.Science-Kunden ausgerichtet,” erklärt Eric Brégand, Vorstandsvorsitzender von TEMIS. “Diese Lösung, die unternehmensweit einen einheitlichen Datenzugriff bietet, gibt dem Wissenschaftler einen umfassenden Satz an Funktionen zum Aufspüren von Informationen an die Hand, mit dem der Wert von kommerziellen, öffentlichen sowie unternehmensinternen Datenquellen genutzt werden kann.”
Die grundlegende Architektur der Software basiert auf drei aufeinander aufbauenden Schichten:
1. Luxid® Annotation Factory extrahiert spezifische Informationen aus Textdokumenten. Die Anwendung erkennt Texteinheiten und deren Bezüge zuverlässig in unterschiedlichen Sprachen. Über eine intuitiv zu bedienende Benutzeroberfläche lassen sich Volltexte und Metadaten einfach verwalten.
2. Luxid® Information Mart ist eine einfach zu bedienende Plattform, die verschiedene frei wählbare Quellen(2) zusammenführt und die Verwaltung der analysierten Dokumente in einer Wissensdatenbank übernimmt.
3. Luxid® Information Analytics ist ein webbasiertes Portal mit vielen Zusatzfunktionen für Suche und Auswertung, das auf Luxid® Information Mart aufbaut. Seine innovative Benutzeroberfläche bietet erweiterte Such- und Filterfunktionen sowie Dokumentennavigation, Zeitreihenanalyse, tabellarische Ansichten, Informationsmapping und -clustering. Der einzigartige Knowledge Browser verwandelt jedes Dokument in ein navigierbares Wissensnetzwerk, mit dem die semantischen Bezüge der extrahierten Einheiten angezeigt werden. Das System bietet zudem mit den so genannten Centers of Interest die Möglichkeit, einmal durchgeführte Analysen vorzuhalten und deren Ergebnisse mit anderen Anwendern zu teilen.
Als Rückgrat für Luxid® for Life Sciences kommt der Standard UIMA(4) zum Einsatz. UIMA stellt eine generische und offene Basis für Anwendungen zur Analyse und Verarbeitung von unstrukturierten Daten dar und bietet dem Anwender die Option auf einfache Integrierbarkeit weiterer, UIMA-kompatibler Komponenten, wie etwa der IBM Suchmaschine OmniFind. Darüber hinaus skaliert das System dank UIMA durch die Möglichkeit, zusätzliche Rechenkapazität einfach per Mausklick am System anzumelden und verfügbar zu machen. UIMA, ursprünglich ein Projekt des US-Computerkonzerns IBM, wurde kürzlich als Open-Source-Software verfügbar gemacht.
Verfügbarkeitsinformation
Luxid® ist jetzt erhältlich. Für weitere Informationen besuchen Sie bitte unsere Website www.temis.com oder schicken Sie uns eine E-Mail an info@temis.com
- (1) Luxid® unterstützt 20 Sprachen: Tschechisch, Niederländisch, Englisch, Französisch, Deutsch, Griechisch, Ungarisch, Italienisch, Polnisch, Portugiesisch, Russisch, Spanisch - Arabisch, Chinesisch, Japanisch, Koreanisch - Finnisch, Schwedisch, Norwegisch Bokmal und Dänisch.
- (2) TEMIS-Annotationsanwendungen für die Biowissenschaften:
- Competitive Intelligence Life Sciences edition Annotator extrahiert kritische Informationen wie etwa Fusionen und Übernahmen, den klinischen Status von pharmazeutischen Produkten, Lizenzvereinbarungen oder Entscheidungen und Zulassungen der amerikanischen Arzneimittelbehörde. Die Anwendung umfasst die Namen von über 3000 Unternehmen sowie ihrer Joint Ventures und Firmenverflechtungen.
- Biological Entity Relationships Annotator extrahiert biologische Mechanismen (Genexpressionen, Protein-Interaktionen, Lokalisierungen etc.) aus wissenschaftlicher oder medizinischer Fachliteratur.
- Medical Entity Relationships Annotator erkennt Informationen über Pharma-Gesetzgebung, klinische Studien, Therapeutik, Diagnostik und Gegenanzeigen und kombiniert diese mit einer umfassenden medizinischen Taxonomie.
- Chemical Entity Relationships Annotator identifiziert chemische Substanzen und setzt die extrahierten Namen in chemische Strukturen um.
- (3) Websites, Presseerklärungen, Blogs, wissenschaftliche und Patentdatenbanken, interne Inhalte.
- (4) UIMA: Unstructured Information Management Architecture http://www.research.ibm.com/...)
In kaum einem Bereich sind die Anforderungen an die Analyse von textuellen Informationen so hoch wie in diesem Gebiet. Viele tausend Proteine oder Krankheiten, viele Millionen von Organismen und buchstäblich unzählige chemische Substanzen können auf vielfältige Arten und Weisen mit einander interagieren. Die Suche nach einem viel versprechenden Wirkstoff oder das frühzeitige Aufspüren von unerwünschten Nebenwirkungen gleicht oft der sprichwörtlichen Suche nach der Nadel im Heuhaufen. Die stürmische Publikationstätigkeit der Wissenschaft und die hohen Anforderungen der Zulassungsbehörden tun ein Übriges, um die Suche nach geeigneten Verfahren der Textanalyse zu befeuern.
TEMIS Luxid® for Life Sciences greift diese Bedürfnisse auf und unterstützt die Wissenschaftler aus den Forschungs- und Entwicklungsabteilungen bei der Auswertung der ständig wachsenden Fachliteratur. Luxid® bietet zahlreiche Funktionen zur Analyse von Beziehungen zwischen biologischen, medizinischen und chemischen Einheiten. Vielfältige Navigationsmöglichkeiten auf den analysierten Texten erlauben es, sich rasch einen Überblick über den Stand der Forschung zu verschaffen und Hypothesen beispielsweise über die Eignung einer Zielsubstanz für den medizinischen Einsatz oder Verwendung chemischer Substanzen bewerten können.
Luxid® for Life Sciences unterstützt außerdem Rechtsabteilungen bei der Arbeit mit Patenten. Das System kann verschiedenartige Patentquellen sammeln sowohl die jeweils verfügbaren Metadaten (Einreicher, Patentklassifikationscode…) normalisieren als auch die relevanten Einheiten im Volltext (Gene, Krankheiten, chemische Zusammensetzungen …) analysieren. Patentanwälte können damit rascher patentrechtlich freie Möglichkeiten im Bereich viel versprechender chemischer Zusammensetzungen analysieren und mögliche Patentverletzungen frühzeitig erkennen.
Schließlich unterstützt Luxid® for Life Sciences die Marketing- und Sicherheitsabteilungen bei der Überwachung möglicher Risiken aufgrund von Nebenwirkungen. Die Software automatisiert die Entdeckung von Nebenwirkungen durch die Extraktion relevanter Bezüge zwischen Arzneimitteln, Therapien und dadurch hervorgerufenen pathologischen Befunden oder Symptomen.
”Wir haben unsere erste branchenspezifische Version von Luxid® an den Anforderungen unserer anspruchsvollsten Life-.Science-Kunden ausgerichtet,” erklärt Eric Brégand, Vorstandsvorsitzender von TEMIS. “Diese Lösung, die unternehmensweit einen einheitlichen Datenzugriff bietet, gibt dem Wissenschaftler einen umfassenden Satz an Funktionen zum Aufspüren von Informationen an die Hand, mit dem der Wert von kommerziellen, öffentlichen sowie unternehmensinternen Datenquellen genutzt werden kann.”
Die grundlegende Architektur der Software basiert auf drei aufeinander aufbauenden Schichten:
1. Luxid® Annotation Factory extrahiert spezifische Informationen aus Textdokumenten. Die Anwendung erkennt Texteinheiten und deren Bezüge zuverlässig in unterschiedlichen Sprachen. Über eine intuitiv zu bedienende Benutzeroberfläche lassen sich Volltexte und Metadaten einfach verwalten.
2. Luxid® Information Mart ist eine einfach zu bedienende Plattform, die verschiedene frei wählbare Quellen(2) zusammenführt und die Verwaltung der analysierten Dokumente in einer Wissensdatenbank übernimmt.
3. Luxid® Information Analytics ist ein webbasiertes Portal mit vielen Zusatzfunktionen für Suche und Auswertung, das auf Luxid® Information Mart aufbaut. Seine innovative Benutzeroberfläche bietet erweiterte Such- und Filterfunktionen sowie Dokumentennavigation, Zeitreihenanalyse, tabellarische Ansichten, Informationsmapping und -clustering. Der einzigartige Knowledge Browser verwandelt jedes Dokument in ein navigierbares Wissensnetzwerk, mit dem die semantischen Bezüge der extrahierten Einheiten angezeigt werden. Das System bietet zudem mit den so genannten Centers of Interest die Möglichkeit, einmal durchgeführte Analysen vorzuhalten und deren Ergebnisse mit anderen Anwendern zu teilen.
Als Rückgrat für Luxid® for Life Sciences kommt der Standard UIMA(4) zum Einsatz. UIMA stellt eine generische und offene Basis für Anwendungen zur Analyse und Verarbeitung von unstrukturierten Daten dar und bietet dem Anwender die Option auf einfache Integrierbarkeit weiterer, UIMA-kompatibler Komponenten, wie etwa der IBM Suchmaschine OmniFind. Darüber hinaus skaliert das System dank UIMA durch die Möglichkeit, zusätzliche Rechenkapazität einfach per Mausklick am System anzumelden und verfügbar zu machen. UIMA, ursprünglich ein Projekt des US-Computerkonzerns IBM, wurde kürzlich als Open-Source-Software verfügbar gemacht.
Verfügbarkeitsinformation
Luxid® ist jetzt erhältlich. Für weitere Informationen besuchen Sie bitte unsere Website www.temis.com oder schicken Sie uns eine E-Mail an info@temis.com
- (1) Luxid® unterstützt 20 Sprachen: Tschechisch, Niederländisch, Englisch, Französisch, Deutsch, Griechisch, Ungarisch, Italienisch, Polnisch, Portugiesisch, Russisch, Spanisch - Arabisch, Chinesisch, Japanisch, Koreanisch - Finnisch, Schwedisch, Norwegisch Bokmal und Dänisch.
- (2) TEMIS-Annotationsanwendungen für die Biowissenschaften:
- Competitive Intelligence Life Sciences edition Annotator extrahiert kritische Informationen wie etwa Fusionen und Übernahmen, den klinischen Status von pharmazeutischen Produkten, Lizenzvereinbarungen oder Entscheidungen und Zulassungen der amerikanischen Arzneimittelbehörde. Die Anwendung umfasst die Namen von über 3000 Unternehmen sowie ihrer Joint Ventures und Firmenverflechtungen.
- Biological Entity Relationships Annotator extrahiert biologische Mechanismen (Genexpressionen, Protein-Interaktionen, Lokalisierungen etc.) aus wissenschaftlicher oder medizinischer Fachliteratur.
- Medical Entity Relationships Annotator erkennt Informationen über Pharma-Gesetzgebung, klinische Studien, Therapeutik, Diagnostik und Gegenanzeigen und kombiniert diese mit einer umfassenden medizinischen Taxonomie.
- Chemical Entity Relationships Annotator identifiziert chemische Substanzen und setzt die extrahierten Namen in chemische Strukturen um.
- (3) Websites, Presseerklärungen, Blogs, wissenschaftliche und Patentdatenbanken, interne Inhalte.
- (4) UIMA: Unstructured Information Management Architecture http://www.research.ibm.com/...)
